Hombre, un hinchable normalmente se compra porque no podemos permitirnos uno "entero", ya sea por precio, por gusto, etc... pero principalmente diría por espacio a la hora de guardarlo, así como transportarlo.
Ahora bien, si sobre tu baca el kayak no se resiente, yendo quizá algo bajo de presión, y tienes sitio para guardarlo así entero, no veo por qué lo tengas que deshinchar del todo.
Yo cuando usaba el mío hinchable, estaba obligado a desinflarlo, para meterlo en el coche, ya que ni tenía baca. Luego en casa, a dejarlo airear, cuando volvía a remar, pues de nuevo lo hinchaba.
Pero si tuviera baca ya, quizá me ahorraba tanto darle a la palanca.