Cuando se empieza a diseñar un kayak en un programa lo primero que se hace es ajustar la eslora y la manga, luego se hace el resto.
Si coges un kayak ya probado y con un buen aspecto y le cambias las dimensiones, todo el resto va a cambiar, la estabilidad, direccionabilidad, el arrufo, su comportamiento con las olas, y su aspecto.
Antes de cambiar tanto "a ojo" creo que es mejor diseñar uno desde cero en un programa.
Pero estas convencido de seguir con el proyecto, te recomiendo que lo montes con los mamparos macizos (tal como se ve en las fotos que subiste, sin vaciar el interior) y con un recubrimiento de plástico provisional (sale entre 3 y 5 €), pegado con cinta de empaquetar, así podrás probarlo, y si no te gusta el resultado solo tienes que desmontarlo y cortarle lo necesario a los mamparos.
Suerte