Desde la teoría pura y dura...
Lo del plástico debería funcionar. Otra posible opción, más o menos inspirada en algo que se hacía en los kayaks tradicionales del Este de Groenlandia, podrían ser dos tiras de contrachapado (3-5 mm de grosor, quizá) de la anchura que juzgues adecuada situadas paralelas y una a cada lado del larguero de quilla. Que vayan por debajo de, por ejemplo, una o dos costillas a popa de la que lleva el alza, pasen por encima de esta y terminen otra vez por debajo de la siguiente a proa de la costilla problema. Al parecer esto evitaba bastante que se engancharan los talones (si es eso lo que te preocupa) .
Lo de las costillas laminadas, el KOG cuenta que en los kayaks tradicionales que desarrollaban el problema de deformación del casco al hundirse la quilla (o para prevenirlo) se "laminaba" sobre la costilla ya instalada una pieza recta de madera a base de ligadas. Por si te animas... O controla un poco como van las cosas y al primer síntoma, laminas, tradicional o con cola. Igual hay suerte y no pasa nada y te lo evitas. Eso sí, con este barco, yo estaría bastante atento. También según el KOG, los qajaqs de fondo plano y ancho son especialmente proclives a esta deformación (lógico).