En primer lugar, tienes que hacerte una idea, de cual es el motivo de tales agujeros. Puede que el antiguo propietario, le pusiera un cañero (por ejemplo). Es posible que en un futuro a ti también te interese colocarle uno, con lo cual no tienes que reparar nada, sino comprarle un cañero similar y aprovechar los agujeros ya hechos.
Si no te interesa poner cañeros, sonda o lo que sea, que haya llevado antes tu kayak, simplemente le puedes poner unos tornillos con unas arandelas de goma, para que no te entre agua por ellos.
Otra solución es sellarlos con silicona.
La definitiva, es soldar con polietileno (a ser posible sacado del mismo kayak o suministrado por el fabricante). Busca con el buscador, temas de reparación de kayaks de polietileno (hay muchos e incluso con vídeos).
Saludos dersde Almería.
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