Hola Maikol, bienvenido.
Para contestarte, voy por partes:
La bañera: Por las fotos que muestras, a tu kayak le falta la brazola, el borde de la bañera que forma un reborde hacia afuera y en el que se ancla el cubrebañeras; no se cómo podrías rehacer esa pieza que falta, pero en la página de Tom Yost
www.yostwerks.com indica cómo hacer una brazola a partir de una manguera de riego. Aunque es para kayaks desmontables igual te vale el sistema.
Las tapas: Yo he instalado en kayaks de fibra las tapas que muestras en el segundo enlace, pero creo recordar que las mias son de 190 mm de diametro. Por experiencia te digo que para llevar algo mas que el bocadillo y alguna cosilla en una bolsa estanca pequeña, resultan pequeñas. Para instalarlas es importante hacer el agujero muy ajustado, lijar y sellar bien con masilla de poliuretano (sikaflex o similar) y montar toda la tornillería con arandelas. Tambien hay tiendas de kayak que te pueden suministrar tapas ovales de kayak de mar con sus cuellos correspondientes, pero en cuanto a precio, se multiplica aprox. por 10.
Los tabiques: yo hice una plantilla de carton, luego el tabique de contrachapado y lo laminé con fibra de vidrio y resina de poliester por ambas caras, recorté, ajusté y lo encolé con masilla de poliuretano, pero si lo tuviera que hacer ahora, buscaba espuma de alta densidad para hacer los tabiques (como la de las tablas de body board o planchas de espuma para construccion) y lo sellaba igual; La espuma se adapta al contorno del casco y no genera puntos "duros".
Un saludo y suerte con la reparación.