Xema, una buena brazola, su reborde, debe tener cierta caída, es decir, no plano. De ese modo el cubre se asienta en más superficie (no sólo justo el borde donde abrazaría el cubre). Lo que trato de decirte se aprecia bien en la imagen con la brazola sobredimensionada, digamos que el borde horizontal tiene x distancia, y el cubre se claramente que toca en él casi la mitad. Si ese reborde tiene cierta caída (su parte exterior algo más baja que la interior), logras que el cubre toque en toda su superficie.
La goma no tiene porque asentar en nada más, con tal de hacerla someter bajo el reborde ella misma tiende a apretarse, cerrando el conjunto, digo yo.
Aunque realmente con las palabras que explicas no acabo de ver claramente el problema. Sí es verdad que he visto la imagen anterior, respecto al diseño de la bañera, y veo una brazola "rara" (aunque realmente lo que se ve marcado ahí sería por donde vas a cortar ¿no?)

Para colocarle unas musleras éstas no tienen que llegar a la punta delantera de la brazola. Puedes hacer una brazola normal (con forma de huevo o
Herradura) y luego añadirle las musleras en su sitio justo, típico por ejemplo de las que llaman bañeras de
cerradura (porque parece la cerradura de una puerta).
http://www.kayakdemar.org/index.php?topic=12405.5 Una pena que falten algunas imágenes que en su día existían.
Ahí tienes las llamadas "de cerradura"

De todos modos, mírate bien el diseño de las muslera, porque al menos yo hablo por mí, en mi Solaris, es la propia forma de la bañera la que permite ajustar las piernas bajo ella. Tiene bastante altura la bañera, y llevas las piernas bien escanchadas, las metes y sacas sin nada que te limite (como sí hacen unas musleras añadidas), y en cuanto quieres "amarrarte" a ella, sólo tienes que abrir las rodillas y hacer tope entre los pies y las rodillas (parte inferior interna del muslo), Claro que su apertura es algo diferente a la estándar, siendo más corta a lo largo. 76-77 cm. en lugar de en torno a 85.
http://www.kayakdemar.org/index.php?topic=9409.0Así voy yo
http://www.kayakdemar.org/index.php?topic=10893.msg126089#msg126089