Dayana, no sé cómo llevarás el asunto, pero he visto unas fotos que te gustará verlas.
En su día Freya llevaba a su hijo en el tambucho de atrás, tal cual

Después parece que se lo vendió a un hombre, el cual llevaba a su setter rojo, así

Y aquí se ve la cara de asustado que tiene el pobre, y eso que está en tierra


para mí que se siente atrapado, fíjate que va sujeto con el cubre.
No quiero imaginar ante un vuelco, lo que le puede pasar al perrito, como el dueño tenga sus problemas propios.
Si llevara un perro en mi kayak de este modo (cosa que no me atrae nada, por el perro más que nada), o sea, cubierto con un cubre, le dejaría al menos las patas delanteras fuera de él. Para mí que así tiene más posibilidades de salir si así lo desea/necesita.